Las obras más conocidas de Fernando de Alvarado Tezozómoc son la presenteCrónica mexicana, escrita en castellano hacia 1598, que relata la salida de Aztlan de los aztecas-mexicas y termina con el inicio de la conquista, y la Cronica mexicayotl, compuesta en nahuatl en 1609, sobre las genealogias de los mas altos pipiltin (nobles) mexicas, y exhibe sus meritos y derechos. La Cronica mexicana cuenta como los mexicas alcanzaron su esplendor y conquistaron el mundo por ellos conocido. Manuel Orozco y Berra, su primer editor, afirmo de la Cronicaque esta:narra las causas que motivaron las guerras y el resultado de estas, dejando traslucir cuanto habia de grosero, de arbitrario, de injusto en la conducta de los monarcas de la triple alianza; los dialogos son naturales, el estilo duro, descuidado, propio de los pueblos a quienes pertenecen: en suma, es la tradicion, la tradicion verdadera que los mexica conservaban en sus seminarios y hacian aprender de coro a los jovenes educandos.El Manuscrito numero 117 de la Hans Peter Kraus Collection of Spanish American Manuscripts esta en la Biblioteca del Congreso de los Estados Unidos de America. Contiene la por ahora version mas temprana de la Cronica mexicana (1598) de Hernando de Alvarado Tezozomoc.Esta version difiere bastante del de la Cronica mexicana publicado por Orozco y Berra en 1878 y luego repetidamente reeditado hasta nuestros dias. Las diferencias son sus 160 folios numerados, en vez de los 158 conocidos. Ademas, de estar dividido en 112 capitulos, en vez de en 110. Tambien hay abundantes acotaciones originales, ausentes todas en la version hasta hoy conocida. Hay, ademas, diferencias significativas en materia de ortografia, de sintaxis y hasta de fraseologia entre uno y otro texto.
Fernando de Alvarado Tezozómoc escribió dos crónicas: Esta Crónica mexicana, escrita en castellano hacia 1598, que relata la salida de Aztlan de los aztecas-mexicas y termina con el inicio de la conquista; y la Cronica mexicayotl, compuesta en nahuatl en 1609, que relata las genealogias de los mas altos pipiltin (nobles) mexicas, y exhibe sus meritos y derechos. Cronica Mexicana se esfuerza particularmente en destacar las excelencias y proezas de los mexica. Se refiere a los campesinos, artesanos, comerciantes, guerreros, sacerdotes y gobernantes, unidos por un origen y una cultura comunes. Tambien plasma un pasado ideal, en el que la valentia y pundonor guerrero de los antepasados les forjaron honores y grandes riquezas.La Cronica mexicana es una fuente de gran importancia para el estudio de la sociedad mexica: narra la historia oficial de la casa gobernante tenochca. Su contenido parte de una narrativa que glorifica el pasado de Tenochtitlan. Puede decirse que Tezozomoc queria enaltecer el legado de la nobleza mexica, a la que pertenecia.Fernando de Alvarado Tezozomoc se educo como cristiano. En consecuencia se le enseño a rechazar a los dioses, mitos y costumbres de los antiguos mexicanos. Sin embargo, el se mantuvo fiel a la memoria de sus antepasados. Se transformo en depositario de la historia oral de su pueblo; y fue uno de los pocos cronistas de origen mexica que dejaron testimonio de su civilizacion.La obra relata como los mexicas alcanzaron su esplendor y conquistaron el mundo por ellos conocido. Manuel Orozco y Berra, su primer editor, afirmo en la introduccion de la Cronica Mexicana que esta:narra las causas que motivaron las guerras y el resultado de estas, dejando traslucir cuanto habia de grosero, de arbitrario, de injusto en la conducta de los monarcas de la triple alianza; los dialogos son naturales, el estilo duro, descuidado, propio de los pueblos a quienes pertenecen: en suma, es la tradicion, la tradicion verdadera que los mexica conservaban en sus seminarios y hacian aprender de coro a los jovenes educandos.